生物工程专业可以分为如下几个研究方向：细胞工程，酶工程，基因工程，发酵工程，生物反应器工程。
细胞工程是生物工程的重要内容，它是以细胞生物学和分子生物学为理论基础，将人类预先设计好的改造方法，在细胞水平上进行细胞改造和大规模细胞培养，获得人类需要的生物产品。其中涉及细胞融合，细胞培养等技术。
又称DNA重组技术，以分子生物学和生物遗传学为基础，利用现代基因生物学技术，将不同来源的基因序列整合到一个生物体遗传物质中，以改变生物原有的遗传特性、获得新品种、生产新产品。
又称蛋白质工程，是指利用酶能加快化学反应速率的催化特性，创造适应的反应条件，在反应器中催化生物反应，使之生产出人类需要的生物产品。它包括酶制剂的制备，酶的固定化，酶的修饰与改造及酶反应器等方面。
利用微生物的生物学特性（如酵母菌发酵制啤酒、面包;乳酸菌发酵制奶酪、酸奶;真菌大规模生产青霉素），为人类生产有用的生物学产品，或者将微生物作为工业生产的参与者，调控者。发酵工程的内容包括菌种的选育、培养基的配制、灭菌、扩大培养和接种、发酵过程和产品的分离提纯等方面。
生物反应器是生物工程中的一种重要设备，不同的生物反应需要不同的生物反应器，一个好的生物反应器对工业生产有巨大的帮助，生物反应器工程旨在研究各种生物反应的特性及各种生物反应器的特性，建立二者之间的关系，如其结构和操作方式、操作条件对细胞形态、生长、产物形成的关系。它与生物反应工程结合，共同解决各种生物反应的最佳生物反应器、最佳操作条件的选择问题。
杨胜利
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生物技术专家，中国工程院院士，中国科学院上海生命科学研究院研究员、博士生导师，中国科学院合成生物学重点实验室学术委员会主任 。杨胜利长期从事于基因工程在酶、发酵和制药工业中的应用研究和开发。
Institutes :Guizhou University
李校堃
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微生物与生物技术药学专家，中国工程院院士、教授、博士生导师，温州医科大学党委副书记、校长、药学学科带头人，基因工程药物国家工程研究中心首席专家，中国残疾人联合会第八届主席团副主席（兼），温州医科大学中西医结合医院名誉院长。
管华诗
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中国工程院院士，中国海洋大学校务委员会名誉主席、学术委员会主任，教授、博士生导师，国家海洋药物工程技术研究中心主任，青岛海洋生物医药研究院院长。
Institutes :Ocean University of China
王晓东
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任职院校：浙江大学医学院。博士，浙江大学神经科学研究所研究员、博士生导师。2011年4月博士毕业于德国马克斯•普朗克精神病学研究所/慕尼黑大学生物学专业；2011年5月至2012年11月于德国马克斯•普朗克精神病学研究所继续从事博士后研究；2013年1月至2013年10月于北京大学第六医院开展研究工作，任助理研究员、副研究员；2013年11月加盟浙江大学医学院。
Institutes :Zhejiang University
施一公
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清华大学生物系任教。1967年5月5日出生于河南省郑州市，1989年毕业于清华大学，1995年在美国约翰霍普金斯大学获博士学位。中国科学院院士、结构生物学家、清华大学教授。现任中国科学技术协会第九届全国委员会副主席，清华大学副校长。[2] 主要从事细胞凋亡及膜蛋白两个领域的研究。在Smad对TGF-的调控机理、磷酸酶PP2A的结构生物学方面做出过有国际影响的工作。曾获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是科技基金会杰出科学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院颁发的2014年度爱明诺夫奖等奖项。美国艺术与科学院院士、美国国家科学院外籍院士、欧洲分子生物学组织外籍成员。
Institutes :Tsinghua University
李明定
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美国明尼苏达大学任教，博士，现任浙大“千人计划”国家特聘教授，博导。主要工作经历及职务包括美国明尼苏达大学助理教授；美国田纳西大学助理教授、副教授和终身教授；美国德克萨斯大学圣安东尼奥健康科学研究中心副教授及终身教授，药物成瘾基因组学和生物信息学部主任
Institutes :Zhejiang University
Molecular biology is the branch of biology that deals with the molecular basis of biological activity. The field of molecular biology studies the biological macromolecules and the macromolecular mechanisms found in living things, such as the molecular nature of the gene and its mechanisms of gene replication and expression. Molecular biology chiefly concerns itself with understanding the interactions between the various systems of a cell, including the interactions between the different types of DNA, RNA and protein biosynthesis as well as learning how these interactions are regulated.
Most of current topics in biological research are involved in molecular biology, resulting in the fast improvement especially after latest advanced technology. Molecular biology is closely related to other biological sciences such as Genetics, Cell biology, Neuroscience and Developmental biology. Its basic principles and techniques are essential for understanding such area of study.
Most of current topics in biological research are involved in molecular biology, resulting in the fast improvement especially after latest advanced technology. Molecular biology is closely related to other biological sciences such as Genetics, Cell biology, Neuroscience and Developmental biology. Its basic principles and techniques are essential for understanding such area of study.
This course emphasizes on understanding of cellular processes involved in the organization and expression of genetics information including systematic introduction to chromosome structure, DNA replication, DNA transposition, genetic code-deciphering, protein synthesis and transport, principle of gene expression and regulation, cancer and oncogene activation, molecular mechanism of HIV, and other basic concepts in molecular biology.
Microbiology is an introductory course dealing with bacteria, fungi, viruses, and other microorganisms. The contents will cover microbial morphology, reproduction, nutrition, growth, metabolism, genetics, mutation, pathogenicity, immune response, and practical application in industry and agriculture.
Biochemistry describes the chemical processes and mechanisms shared by all living organisms. The properties of amino acids; the structure and function of proteins, nucleic acids, lipids and carbohydrates; the kinetics and catalytic mechanisms of enzymes; the functions of vitamin, co-enzyme and hormone; transmembrane transportation; glycolysis; citric acid cycle; TCA cycle; electron transport and oxidative phosphorylation; glycogen metabolism; fat acids metabolism and amino acids metabolism are included in this course.
技能与实验
生化试验，分子生物学实验，动物实验，微生物实验
